负责构建国内科技合作交流平台，实施长三角一体化战略，重点开展与本市内各区县、长三角地区、长江流域地区、对口支援地区以及国内其他区域之间合作模式研究与推广；承担上海市科委国内合作相关类别项目管理工作（以“国内合作项目管理中心”名义对外开展项目管理工作）。
